NW_T053 Cnaphalocrocis medinalis

Specimen name

Order: Lepidoptera Genus: Cnaphalocrocis
Superfamily: Pyraloidea Species: medinalis
Family: Crambidae Subspecies:
Subfamily: Host org.: SRR647915
Tribe: Author:
Subtribe: Type species? unknown

Locality Information

Country: cnaphalocrocis_assembly.fas
Specific Locality: Transcriptome
Latitude: None Max. altitude: None
Longitude: None Min. altitude: None

Collector Information

Code in Insdb: Voucher locality: Collector:
NW_T053 Kawahara
Code in BOLD: Voucher status: Collection date:
unknown
Alternative voucher code: Determined by: Sex:
SRR64791_ unknown

Publication and Notes

Published in: Notes:

Voucher Images

DNA

Extraction: Tube:
Extractor: Date:
SRX216346 None

Sequence Information

Region bp amb. Lab. Accession local Blast NCBI Blast
14-3-3E 792 15   
2ODHa 507 27   
2ODHb 2520 102   
39SrpL24 777 249   
6PFK 2352 45   
6PGD 1452 39   
ADF1 321 0   
ADH 1131 621   
AdK2 732 393   
ADPGK 1470 1074   
ADP-RF1 609 390   
AFG3 1950 1713   
AGBE 2037 72   
AH 2364 75   
AIb 342 147   
AK3 654 36   
AlDH 1539 0   
ArgKin 897 0   
ATP6 681 15 NC_015985   
ATPase1 2100 1155   
ATPase6 333 45   
ATPasea 1668 12   
ATPaseAC39 1047 3   
ATPaseb 741 15   
ATPaseC 249 9   
ATPaseDelta 438 21   
ATPasee 255 15   
ATPaseEpsil 159 0   
ATPaseF 324 51   
ATPaseg 297 27   
ATPaseH 261 0   
ATPaseI 1626 771   
ATPaseIb 1275 420   
ATPaseOS 639 12   
ATPaseProt 615 195   
ATPasesubD 504 162   
ATPCL 1044 42   
ATPgamma 897 12   
ATreP 2379 330   
BPx1 1134 510   
Ca-ATPase 2763 3   
CAH 2694 2475   
Chap6a 1596 96   
chitinase 1680 330   
CHL 621 69   
CMBP5 681 87   
COI 1530 0 NC_015985   
COII 684 3 NC_015985   
COIII 771 0 NC_015985   
COIV 540 57   
COP9 1344 831   
COVa 459 99   
COVb 384 45   
COVIA1 333 9   
COVIIc1 219 51   
CRc1 924 0   
CRis 831 114   
CS 1407 9   
CytB 1113 0 NC_015985   
CytBc18 246 0   
DDC 1287 720   
DDPS 336 99   
DLDH 1509 276   
DnaJ 948 477   
E2C 534 6   
EAP30 756 531   
EF1a 1239 0   
EF1gA 681 15   
EF1gB 495 0   
eno 1299 0   
Exp1 3201 2322   
F16BA 1101 9   
F16BP 1011 399   
FH 1392 429   
ForKin 2220 1455   
G1PU 1524 258   
G6P1E 831 570   
GAPDH 999 51   
GLYP 2532 51   
GPD 1482 219   
GPI 1668 570   
gpts 402 189   
GSS 2016 1752   
GTPb 840 609   
GTPCHI 627 438   
HCADH 2091 18   
HK 1275 369   
IAP 639 204   
IDHa 1188 126   
IDHb 1017 9   
IDHc 1233 81   
IEBF 1092 837   
IF5C 333 3   
JHBP 873 228   
JM 1056 285   
LDH 993 591   
LeuZip 804 420   
LIS 1206 1047   
LPL 576 81   
MalDH 1032 24   
MaNa 441 288   
MDH 717 60   
MK6 945 717   
MPP2 897 144   
NAT10 480 18   
NC 2226 783   
ND1 906 0 NC_015985   
ND1a1 213 54   
ND1a10 1209 81   
ND1a12 435 237   
ND1a13 465 24   
ND1a2 270 96   
ND1a4 249 6   
ND1a5 354 3   
ND1a6 372 0   
ND1a7 339 39   
ND1a8 528 0   
ND1a9 1212 33   
ND1b10 453 0   
ND1b5 570 168   
ND1b6 483 117   
ND2 906 3 NC_015985   
ND3 327 0 NC_015985   
ND4 1347 9 NC_015985   
ND4L 288 0 NC_015985   
ND5 1692 0 NC_015985   
NDF1 1320 27   
NDF2 735 111   
NDFS1 2100 348   
NDFS2 1176 363   
NDFS3 642 234   
NDFS7 534 0   
NDFS8 552 9   
nGTPb1 561 30   
NIDH 1248 270   
NMD3 1449 708   
nuc56 1257 837   
nuc58 1347 567   
OSGEP 1014 708   
P26S12 1377 27   
P26S4 771 27   
PCNA 783 132   
PDH 1209 12   
PDHE1 780 336   
PG 1686 1023   
PGK 1245 0   
PGLYM 738 18   
PIXFT 867 639   
PK 1551 3   
PolII 828 594   
Porin 846 0   
ProSup 1140 501   
PS 513 12   
PSb 696 201   
RAB5 567 192   
Ras 516 9   
RP3E 672 471   
RPF2 843 444   
RpL10 306 0   
RpL10A 645 18   
RpL11 591 84   
RpL12 381 0   
RpL13 666 45   
RpL13A 510 0   
RpL14 429 0   
RpL15 612 0   
RpL17 486 69   
RpL18 552 3   
RpL18A 531 0   
RpL19 597 126   
RpL20 483 249   
RpL21 348 0   
RpL22 450 9   
RpL23 324 0   
RpL24A 582 42   
RpL26 450 72   
RpL27 402 0   
RpL27A 444 0   
RpL28 423 45   
RpL29 219 48   
RpL3 1209 12   
RpL30 339 0   
RpL31 372 0   
RpL32 405 42   
RpL34 366 54   
RpL35 372 3   
RpL35A 477 114   
RpL36 348 21   
RpL36A 312 0   
RpL37 276 3   
RpL37A 270 0   
RpL38 210 30   
RpL39 153 0   
RpL4 1224 159   
RpL5 897 3   
RpL7 789 90   
RpL7A 789 135   
RpL8 768 48   
RpL9 570 0   
RpP0 837 12   
RpP1 216 36   
RpP2 225 45   
RpS10 504 30   
RpS11 330 39   
RpS12 420 3   
RpS13 453 78   
RpS14 453 39   
RpS15 441 0   
RpS15A 390 3   
RpS16 453 0   
RpS17 399 3   
RpS18 456 63   
RpS19 462 60   
RpS2 405 54   
RpS20 372 3   
RpS21 249 0   
RpS23 429 0   
RpS24 396 0   
RpS25 357 57   
RpS26 348 3   
RpS27 252 84   
RpS27A 471 57   
RpS28 195 42   
RpS29 168 0   
RpS2b 513 297   
RpS3 729 42   
RpS30 393 3   
RpS3A 807 75   
RpS4 789 0   
RpS5 606 6   
RpS6 759 60   
RpS7 570 0   
RpS8 630 6   
RpS9 582 51   
RpSA 663 3   
SDH 1836 327   
SDHFS 852 411   
SL 1458 555   
slowmo 684 147   
SOD 654 39   
SPT16 2811 2373   
STPP 927 33   
SucCL 1143 813   
SucCoA 930 12   
SucCoAb 1269 57   
TA 999 48   
TfB 1353 123   
TFIIF 801 534   
TFS 594 393   
TGF 777 0   
TIF2A 951 93   
TIF3B 2130 42   
TIF3Ca 498 93   
TIF3Cb 1773 1056   
TIF3K 642 222   
TIF3M 1116 432   
TIF4A 1155 168   
TIF5A 480 0   
TIF6 735 39   
TK 1878 42   
TPI 744 0   
Trop 768 6   
U1A 354 132   
UBCc 447 15   
UCCR7 300 9   
UCTH 1233 966   
UDPGAD 1113 909   
vacA 1854 162   
vacATPc 1071 42   
vacATPd 666 0   
vacATPE 681 48   
vacATPF 375 3   
vacATPg 351 0   
vacATPH 1029 3   
vacB 1482 0   
VATPc 462 9   
VPS4 1326 1098   
WD40 945 450   
WPH 822 174   
None 465 306   
None 468 87   
None 675 210